总RNA提取是从细胞或组织样本中分离高质量RNA的重要步骤,用于后续的RT-qPCR、RNA-Seq和Northern blot等分析。以下是总RNA提取的基本流程及其优点:
总RNA提取技术路线
1.样本收集和裂解
• 新鲜样本或冻存样本:收集新鲜组织或细胞样本,或使用液氮快速冷冻样本。
• 加入裂解缓冲液:使用含有胍盐(如胍硫氰酸盐)的裂解缓冲液裂解细胞,抑制RNase酶的活性,保持RNA完整性。
2.去除蛋白质和脂质
• 酚/氯仿抽提:加入等体积的酚/氯仿混合物,涡旋混匀并离心,分离蛋白质和脂质到有机相。水相保留RNA。
3.RNA沉淀
• 加入异丙醇:将水相转移到新的离心管中,加入等体积的异丙醇沉淀RNA,混匀并在4°C下孵育10分钟。
• 离心回收RNA:在4°C、12000g条件下离心10-15分钟,收集RNA沉淀。
4.RNA洗涤和溶解
• 70%乙醇洗涤:用70%冷乙醇洗涤RNA沉淀,以去除盐分和杂质。
• 溶解RNA:干燥RNA沉淀后,用适量的RNase-free水或TE缓冲液溶解RNA。
5.RNA质量和浓度检测
• 光密度测定:使用分光光度计测定260/280 nm比值,评估RNA纯度。
• 电泳检测:通过琼脂糖凝胶电泳确认RNA的完整性(rRNA条带清晰无降解)。
总RNA提取技术优点
1.高完整性和高纯度:提取步骤可以有效去除DNA、蛋白质和脂质,获得高质量的RNA,适合精密分子生物学分析。
2.RNase抑制:提取过程中使用RNase抑制剂,防止RNA降解,保证RNA的完整性。
3.广泛适用:适用于各种类型的生物样本,包括动物、植物、细菌和真菌。
4.高产量:能够从少量样本中提取足够的RNA用于多种下游分析。
5.快速高效:常规实验室条件下可以快速完成,总RNA提取耗时较短。
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