高通量测序

更新时间:2024-09-26    浏览量:0

高通量测序服务包括各种基于下一代测序(NGS)技术的应用,能够快速、大规模地获得生物样本的序列信息,涵盖基因组、转录组、表观遗传组等多层次的分析。具体内容包括以下几个方面:

1.全基因组测序(WGS):

• 目的:全面分析一个物种或个体的基因组序列,揭示基因组结构变异、单核苷酸多态性(SNP)、插入缺失(InDel)等。

• 流程:

  • 样本准备:提取高质量的基因组DNA。

  • 文库构建:将DNA片段化,添加接头构建测序文库。

  • 高通量测序:使用Illumina、PacBio或Oxford Nanopore等平台进行测序。

  • 数据分析:序列比对、变异检测、功能注释、基因组组装。

  • 应用:个体基因组测序、进化研究、基因组变异分析、疾病基因组学。


2.全外显子组测序(WES):

• 目的:专注于编码区序列的测序,快速发现与疾病相关的突变。

• 流程:

  • 样本准备:提取基因组DNA。

  • 外显子捕获:使用探针捕获外显子区域。

  • 文库构建和测序:构建测序文库并进行高通量测序。

  • 数据分析:序列比对、突变检测、注释分析。

  • 应用:遗传病研究、癌症基因突变检测、基因功能研究。


3.转录组测序(RNA-seq):

• 目的:研究基因表达水平、转录本变异、可变剪接、基因融合等。

• 流程:

  • 样本准备:提取总RNA或mRNA。

  • cDNA合成:将mRNA逆转录为cDNA。

  • 文库构建和测序:构建测序文库并进行测序。

  • 数据分析:基因表达定量、差异表达分析、可变剪接检测、基因融合分析。

  • 应用:基因表达研究、发育生物学、疾病分子机制研究。


4.靶向测序:

 目的:针对特定基因组区域(如特定基因、基因集、热点突变区)进行测序。

• 流程:

  • 靶向区域捕获:利用探针或PCR扩增富集目标区域。

  • 文库构建和测序:将捕获的目标区域进行文库构建和测序。

  • 数据分析:突变检测、变异频率分析。

  • 应用:癌症基因组学研究、遗传病诊断、基因组编辑检测。


5.表观遗传组测序:

 目的:研究基因组DNA甲基化状态、组蛋白修饰和染色质结构变化。

• 流程:

  • 样本处理:DNA甲基化测序需要进行亚硫酸氢盐处理;ChIP-seq需要进行蛋白-DNA复合物的免疫共沉淀。

  • 文库构建和测序:构建适合测序的文库并进行测序。

  • 数据分析:甲基化位点分析、组蛋白修饰分析、染色质结构分析。

  • 应用:癌症表观遗传学研究、发育生物学、环境遗传学。


6.微生物基因组和宏基因组测序:

 目的:测序并分析单一微生物或环境样本中微生物群落的基因组信息。

• 流程:

  • DNA提取:从微生物单一菌株或环境样本中提取DNA。

  • 文库构建和测序:构建文库并进行高通量测序。

  • 数据分析:基因组组装、功能注释、微生物群落组成分析。

  • 应用:环境微生物研究、人体微生物组研究、病原微生物鉴定。


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